全自动农药残留检测仪检测前需要通过溶解对果蔬样品中的农药残留物质进行溶解和分离。由于果蔬产品中的农药使用种类的不同，农药残留物质提取溶剂和方法也会有相应的变化。有机溶剂提取效果对于最终农药残留检测结果产生重要影响。合适的溶剂能够提高农药残留检测结果准确性与测量速度。
全自动农药残留检测仪有机溶剂的选择要与待测农药极性相似，提取剂沸点应45～80℃，且不能与样本发生作用，毒性低，价格便宜，必须能溶解待测农药。采用ECD时，不能选带卤素的溶剂。对含水量高的样本，一般选与水相混溶的溶剂(乙腈、丙酮等)，要求溶剂对样本有较强的渗透能力，以便能将样本中农药充分提取。
目前我国市售的农药残留检测仪有机溶剂几乎都需纯化后方可使用。
方法：多采用重蒸馏的方法。纯化后的溶剂检验方法是将溶剂浓缩100倍，吸取1?l注入气相中无干扰峰即符合要求。也可采用中性氧化铝、硅胶、活性炭等吸附剂制成层析柱纯化。
目前，全自动农药残留检测仪有机溶剂的提取方法大致可以分为以下几种，它们各有各的特点。超声法：样本加入提取剂，以超声波提取。快速混匀法：适用于液体样品。振荡法：在盛有样本的容器中加提取剂，振荡一定时间。索氏提取：提取效果好，但时间长，干扰物多。多用于动物样本。
