由酶联免疫吸附实验法可知，酶标仪应该用比色法来分析抗原或抗体的含量，即它应依照比色原理进行工作。实际上，酶标仪就是一台变相的光电比色计或分光光度计，其基本工作原理与主要结构和光电比色计几乎相同。
便携式酶标仪所用的单色光既可通过相干滤光片来获得，也可用分光光度计相同的单色器来得到。在使用滤光片作滤波装置时与普通比色计一样，滤光片即可放在微孔板的前面，也可放在微孔板的后面，其效果是相同的。光源灯发出的光经聚光镜，光栏后到达反射镜，经反射镜作90°反射后垂直通过比色溶液，然后再经滤光片送到光电管。
酶标仪可分为单通道和多通道两种类型，便携式酶标仪属于单通道酶标仪，单通道又有自动和手动两种分类。自动型的仪器有X，Y方向的机械驱动机构，可将微孔板L的小孔一个个依次送入光束下面测试，手动型则靠手工移动微孔板来进行测量。
便携式酶标仪在食品卫生，农业以及畜牧行业可检测的项目主要有营养成分、添加剂、农药残留量、菌毒素、无机毒素、抗生素激素残留、致癌物质残留、有毒有害物质污染等。在医疗行业可检测的项目主要分为以下几种：
一、过敏原：皮肤不耐受等;
二、甲状腺：促甲状腺激素，T3T4等;
三、糖尿病：C肽，胰岛素，胰岛素抗体，胰岛素原等;
四、弓形虫抗体，巨细胞病毒，风疹病毒等;
五、性激素六项，泌乳素，雌三醇，生长素等;
六、传染病类：例如肝炎，艾滋病，衣原体，肺炎支原体，梅毒，水痘等;
七、肿瘤标志物：癌胚抗原，甲胎蛋白，乳腺癌，卵巢癌，膀胱癌，胃肠癌等。
